Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vdac1Q60932 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vdac1Q60932 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vdac1Q60932 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vdac1Q60932 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vdac1Q60932 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vdac1Q60932 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vdac1Q60932 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vdac1Q60932 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms