Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klf4Q60793 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klf4Q60793 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms