Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a1Q60737 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a1Q60737 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms