Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PtprnQ60673 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PtprnQ60673 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PtprnQ60673 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprnQ60673 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprnQ60673 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PtprnQ60673 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms