Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr2f1Q60632 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr2f1Q60632 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr2f1Q60632 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms