Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sin3aQ60520 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sin3aQ60520 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms