Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Setd5Q5XJV7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setd5Q5XJV7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms