Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdcp1Q5U462 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms