Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rabl6Q5U3K5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabl6Q5U3K5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabl6Q5U3K5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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