Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms