Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myh1Q5SX40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myh1Q5SX40 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms