Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mks1Q5SW45 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mks1Q5SW45 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mks1Q5SW45 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms