Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bbs12Q5SUD9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbs12Q5SUD9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms