Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930512M02RikQ5SQK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930512M02RikQ5SQK8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms