Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trav2Q5R1I9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms