Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nsrp1Q5NCR9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms