Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1810065E05RikQ5NC41 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1810065E05RikQ5NC41 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms