Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chsy3Q5DTK1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chsy3Q5DTK1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms