Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2f8Q58FA4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f8Q58FA4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms