Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccnl1Q52KE7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccnl1Q52KE7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccnl1Q52KE7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms