Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc84Q4VA36 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms