Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc110Q3V125 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc110Q3V125 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms