Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms