Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clpsl2Q3UW21 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clpsl2Q3UW21 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms