Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chpf2Q3UU43 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chpf2Q3UU43 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chpf2Q3UU43 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms