Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a11Q3USY0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a11Q3USY0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a11Q3USY0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a11Q3USY0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc38a11Q3USY0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc38a11Q3USY0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc38a11Q3USY0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc38a11Q3USY0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms