Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep63Q3UPP8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep63Q3UPP8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep63Q3UPP8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms