Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln5Q3UMW8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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