Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrch2Q3UMG5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrch2Q3UMG5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms