Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cog7Q3UM29 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cog7Q3UM29 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cog7Q3UM29 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms