Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BtrcQ3ULA2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtrcQ3ULA2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms