Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrxosQ3UL53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms