Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E330014E10RikQ3UL33 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E330014E10RikQ3UL33 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms