Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ceacam5Q3UKK2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ceacam5Q3UKK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ceacam5Q3UKK2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ceacam5Q3UKK2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms