Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smu1Q3UKJ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smu1Q3UKJ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms