Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm648Q3UJ22 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm648Q3UJ22 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms