Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dtx3lQ3UIR3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dtx3lQ3UIR3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms