Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc58Q3UGP9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrc58Q3UGP9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrc58Q3UGP9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms