Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Carmil3Q3UFQ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms