Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Puf60Q3UEB3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Puf60Q3UEB3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms