Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U6N9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U6N9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U6N9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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