Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem88bQ3TYP4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms