Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21440Q3TTD8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21440Q3TTD8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms