Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ctdnep1Q3TP92 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdnep1Q3TP92 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdnep1Q3TP92 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms