Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gtf3c3Q3TMP1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c3Q3TMP1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms