Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RubcnlQ3TD16 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RubcnlQ3TD16 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms