Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc69Q3TCJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms