Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem248Q3TBN1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem248Q3TBN1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms