Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem104Q3TB48 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem104Q3TB48 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms