Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M3Q31093 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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H2-M3Q31093 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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H2-M3Q31093 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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H2-M3Q31093 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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H2-M3Q31093 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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H2-M3Q31093 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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H2-M3Q31093 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M3Q31093 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M3Q31093 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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